Vintage B3 は、実機の B3 が備えているスキャナビブラートをエミュレートします。ほとんどのオルガン奏者は、スキャナビブラートを独立に使うことはあまりなく、レスリースピーカーの効果とうまく組み合わせます。もっとも、B3 の名手と言われたブライアン・オーガーのように、オルガンそのものに組み込まれたビブラートを好む奏者もいます。コーラスやビブラートの効果と、ロータリーキャビネットをシミュレートした効果を比べて、どちらが好みか確かめてみてください。
スキャナビブラートは、いくつかのローパスフィルタで構成される、アナログ・ディレイ・ラインによる効果です。ディレイラインの信号を、回転スキャナの付いた多極コンデンサスイッチでスキャンします。LFO（低周波オシレータ）ではシミュレートできない、独特の音響効果が得られます。オルガン自体にもビブラートエフェクトが組み込まれています。これは、スピーカーの回転によって得られるレスリー効果とは別のものです。Vintage B3 では、どちらもシミュレートできるようになっています。
スキャナビブラートを使ったコーラス効果は、音程が定まった原音信号とビブラート信号をミックスして作られます。このオルガンのコーラスサウンドは、最新式のコーラスエフェクトとは異なります。
重要：スキャナビブラートとコーラスのコントロールは 2 つのウインドウに分散しています。コントロールバーで「Main」をクリックし、右下の「Controls」ボタンをクリックして表示されるウインドウには、「On/Off」スイッチとタイプ（ビブラートまたはコーラス）選択コントロールがあります。コントロールバーで「Options」をクリックして表示されるウインドウには、「Rate」コントロールと「Depth」コントロールがあります。
「Upper/Lower」スイッチ：上段と下段の鍵盤それぞれについてスキャナビブラートのオン／オフを切り替えます。ビブラートをかけるとオルガンの高音部が多少強調されます。B3 ではバスレジスタ（ペダル）信号と下鍵盤の信号がミックスされるため、下鍵盤のスキャナビブラート設定がペダルレジスタにも反映されます。
「Type」ノブ／フィールド：3 種類のビブラート設定（V1、V2、V3）と 3 種類のコーラス設定（C1、C2、C3）のいずれかを選択します。ビブラート設定では、ディレイラインの信号のみが聞こえます。Hammond B3 と同様に、種類によってビブラートの強度が異なります。3 種類のコーラス設定（C1、C2、C3）では、原音とディレイラインから得られた信号がミックスされて出力されます。
「Rate」ノブ／フィールド：ビブラートまたはコーラスの速度を設定します。
「Depth」ノブ／フィールド：ドライ信号（原音）とコーラス信号を混合します。このパラメータは、コーラス設定（C1、C2、または C3）のいずれかが選択されている場合のみ有効になります。